4月2日，蘇州市疾控中心在疫情發(fā)布會(huì )上介紹，該市發(fā)現奧密克戎BA.1.1進(jìn)化分支，在多個(gè)數據庫中均未發(fā)現新冠病毒基因組高度同源序列。
國內出現了此前未有的奧密克戎新變異？這個(gè)變異如何出現？新冠病毒是不是又進(jìn)化了？疫情還防不防得??？
盡管蘇州市疾控中心強調，需要一定時(shí)間來(lái)分析比對才能公布進(jìn)一步信息。但這個(gè)新變異仍引起了廣泛關(guān)注和不少猜測，登上熱搜。帶著(zhù)上述問(wèn)題，科技日報記者連線(xiàn)采訪(fǎng)了國家級數據平臺的一位病毒學(xué)專(zhuān)家。
僅憑測序相似程度判斷為時(shí)過(guò)早
“‘未發(fā)現高度同源的序列’，這樣的說(shuō)法不夠科學(xué)?！痹搶?zhuān)家表示，首先，該報道想表述的意思應該是“高度相似的序列”，在生物進(jìn)化研究中，“同源”只能被描述為“是”或者“否”；其次，“高度”的含義不夠精確，99.9%和99%都可能被認為是“高度”，但是這兩個(gè)相似性之間的差異引起的序列數量變化高達200多個(gè)核苷酸；最后，基因組序列變化并不意味著(zhù)病毒的傳播力、感染力、致病力等必然會(huì )發(fā)生變化，不能僅僅根據序列差異數量判斷是否出現新的流行變異株，而應進(jìn)一步分析序列變異有沒(méi)有引起對應氨基酸的變化，這個(gè)變異又發(fā)生在哪個(gè)蛋白上，如果是重要蛋白是否在關(guān)鍵區域。只有這些都研究清楚了，才能夠知道新的毒株可能產(chǎn)生的后果。
是否為“新分支”目前尚不確定
蘇州市疾控中心通報中提到，發(fā)現奧密克戎變異株BA.1.1進(jìn)化分支，是不是說(shuō)明已經(jīng)變異到一定程度了呢？
“對于新冠病毒的新分支，國際上有不同的定義?！痹搶?zhuān)家對科技日報記者表示，有的定義比較粗放、有的比較細致。學(xué)術(shù)界有不同的分類(lèi)方法，設立了不同的標準。
科技日報記者查詢(xún)文獻資料了解到，有學(xué)者在分析了35000多條新冠病毒基因組信息后，在2020年7月提出了動(dòng)態(tài)命名的方法 “PANGO”，其他學(xué)者也提出過(guò)不同的分類(lèi)方法。
以較為廣泛應用的“PANGO”法為例，該方法規定：一個(gè)新的子分支，必須有充分系統發(fā)育證據，證明后代譜系在某個(gè)不同地理區域人群中的流行過(guò)程中從祖先譜系向后代譜系的進(jìn)化過(guò)程，也就是說(shuō)子分支必須有實(shí)質(zhì)性地向前傳播。目前而言，僅從一位感染者中檢測到該變異序列，難以證實(shí)其有實(shí)質(zhì)性地向前傳播，因此不一定能被定義為新分支。
“新分支”不足為奇，有可能“自生自滅”
“此輪本土疫情已經(jīng)持續了一個(gè)多月了，按照新冠病毒的變異速度，出現2個(gè)左右的變異是正常的?！痹搶?zhuān)家表示，但并不是說(shuō)新冠病毒一出現新分支就都會(huì )變成厲害的變異株，只有比較“適應”的病毒才有可能存活下來(lái)，即便存活下來(lái)，也未必會(huì )發(fā)展成為主流毒株。
“如果你去回溯德?tīng)査局?，?huì )發(fā)現它有很多分支AY.1、AY.2……AY.133，但最后成為主流的只有幾個(gè)?！痹搶?zhuān)家解釋?zhuān)罅康姆种г诹餍械倪^(guò)程中“自生自滅”。因此，即便是出現一個(gè)新的分支，那也無(wú)需過(guò)度恐慌，分支最后未必會(huì )形成主流，也很少會(huì )發(fā)展為更具感染力和致病性的毒株。
重要的是大量采集當前各地新冠陽(yáng)性人員樣本進(jìn)行病毒基因組測序，通過(guò)生物信息學(xué)方法密切監測變異情況，及時(shí)發(fā)現主流毒株，研發(fā)有效的疫苗、抗病毒藥物和檢測試劑，實(shí)現對疫情的防控。
（原標題《蘇州發(fā)現奧密克戎新分支？專(zhuān)家：憑測序相似程度判斷為時(shí)過(guò)早》）